Для некоторых заболеваний свежевыжатые соки имеют явные противопоказания. Так употребление кислых соков: яблочного, апельсинового, клюквенного, смородинового противопоказано в случаях обострения панкреатита и гастрита, а также язвенной болезни. Эти соки содержат множество различных органических соединений, повышающих уровень кислотности желудочного сока, что сопровождается изжогой и приступами боли. Употребление виноградного сока противопоказано при излишней полноте и болеющим сахарным диабетом. Этот сок содержит слишком много калорий и глюкозы. Кроме того, виноградный сок противопоказан людям с синдромом разраженного кишечника. Многим свежевыжатым сокам присуще оказание послабляющего действия. Поэтому при наблюдаемой склонности к поносам такие соки необходимо предварительно разводить в воде и пить небольшими дозами.